項(xiàng)目概況
項(xiàng)目背景
隨著冷凍電鏡應(yīng)用的不斷發(fā)展，單顆粒冷凍電鏡成為了結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究的重要手段之一，但模型重構(gòu)通常需要對(duì)幾萬甚至幾十萬張投影圖片進(jìn)行分析、組裝和優(yōu)化，計(jì)算量十分龐大。
由月新生科構(gòu)建的冷凍電鏡方案，最初采用多核多線程的CPU服務(wù)器進(jìn)行計(jì)算，漫長(zhǎng)的計(jì)算時(shí)間嚴(yán)重阻礙了后續(xù)實(shí)驗(yàn)進(jìn)展。但隨著冷凍電鏡生態(tài)優(yōu)化，大量軟件已支持GPU計(jì)算加速，為進(jìn)一步加速實(shí)驗(yàn)中數(shù)據(jù)的二維和三維處理時(shí)間，現(xiàn)需對(duì)傳統(tǒng)冷凍電鏡方案進(jìn)行異構(gòu)升級(jí)。
解決方案
針對(duì)客戶的異構(gòu)計(jì)算需求，結(jié)合冷凍電鏡實(shí)際科研場(chǎng)景需求，超集信息為其提供了基于EMR/SPR平臺(tái)的高性能液冷工作站解決方案——ServMAX? TL40-X5。
通過雙路EMR/SPR及4張專業(yè)級(jí)GPU搭載，TL40-X5單機(jī)可達(dá)128核心256線程及5940TFLOPS混合算力。在至強(qiáng)平臺(tái)高頻高核的算力支撐下，數(shù)據(jù)集準(zhǔn)備、已處理得到高效優(yōu)化，GPU則利用強(qiáng)大的浮點(diǎn)運(yùn)算能力和并行處理能力實(shí)現(xiàn)了冷凍電鏡三維重構(gòu)軟件的大幅提速，大大縮減了圖像分析、三維重構(gòu)所需時(shí)間。
并且，環(huán)溫28℃條件下，TL40-X5 的 CPU 和 GPU 滿載運(yùn)行溫度穩(wěn)定在 75℃ 以下，且整機(jī)滿負(fù)荷噪音低于50dB，待機(jī)噪音更低至42dB，避免降頻風(fēng)險(xiǎn)同時(shí)，進(jìn)一步實(shí)現(xiàn)了科研環(huán)境條件的優(yōu)化。
客戶價(jià)值
相較傳統(tǒng)CPU方案，搭載GPU的異構(gòu)平臺(tái)大大提升了數(shù)據(jù)處理效率，面對(duì)200 萬左右顆粒的二維分類，每一輪次處理時(shí)間僅需 30-50 分鐘，時(shí)間縮減約97.5%，2000張照片的整體處理時(shí)間可以縮短到2-5天，時(shí)間縮減約85%。并且，超集信息液冷方案憑借更高的算力密度和更低的環(huán)境噪音，使冷凍電鏡科研人員有了更佳的使用體驗(yàn)。
